Depuis plus de 30 ans, la généralisation des nouvelles technologies associées à la génomique offre aux biologistes l'accès au répertoire étendu des composants du vivant et leur permet d'amorcer l'intégration des différents niveaux d'organisation cellulaire pour proposer un agencement fonctionnel des gènes et une interprétation de sa réactivité vis-à-vis de variables ou facteurs externes définissant un phénotype.

Grâce à la possibilité actuelle d'analyser, d'identifier et de quantifier des ensembles de métabolites d'un tissu, d'un biofluide ou d'une communauté cellulaire, l'étude du métabolisme (discipline fondatrice de la biochimie) suscite un vif intérêt. La définition de profils métaboliques, résultants de régulations hiérarchiques (transcription, traduction) et enzymatiques, fournit des indications qui sont le produit de la génétique et de l'environnement.

La pertinence de la plupart des programmes fondés sur l'étude du métabolisme repose à présent sur différentes technologies d'analyse globale des biomolécules. Le recueil des informations métaboliques se fait à l'aide d'outils analytiques de pointe (spectrométrie de masse et résonance magnétique nucléaire) et leur décryptage appelle des solutions bio-informatiques avancées.

La PlateForme "Exploration du Métabolisme" (PFEM) est une infrastructure scientifique et technologique qui réunit l'ensemble des compétences et équipements nécessaires aux études de métabolisme. Mettant en commun des forces du Centre de recherche INRAE Clermont-Theix et de l'Université Clermont Auvergne, cette structure s'est spécialisée pour l'étude du "Métabolome" et du "Protéome" dans des contexte scientifiques de caractérisation i) des aliments ou du statut nutritionnel de l'Homme, et ses dérives associées à diverses pathologies, mais aussi ii) d'évaluation de stimuli environnementaux (biotiques et/ou abiotiques) sur le devenir de systèmes biologiques complexes (e.g. écosystèmes, holobiontes). Grâce à un réseau étendu de collaborations, son implication dans la formation et son rôle moteur au sein de l'infrastructure d'excellence MetaboHUB, la PFEM se positionne comme un acteur majeur à l'échelle nationale et internationale.