Composante Métabolomique

Le catalogue suivant  présente les prestations des composantes INRAE et UCA en Métabolomique.

INRAE

ActivitésTechnologiesDomaine application

Métabolomique non ciblée 

couvrant: acides aminés, acides organiques, acides biliaires, dipeptides, vitamines, carnitines, sucres, steroïdes, lysophospholipides etc…

LC-QToF / LTQ-orbitrap Velos / GC-MS / GC-QToF

Recherche de biomarqueurs dans des fluides biologiques dans les domaines de la nutrition santé (biomarqueurs d'exposition nutritionelle, biomarqueurs d'état métabolique, biomarqueurs prédictifs) 

Matrices biologiques : plasma, serum, urine, tissus, eaux fécales, caecum, contenus digestifs, lait. 

Espèces : humain ou modèles animaux

Métabolomique semi ciblée 

couvrant: acides aminés, acides organiques, acides gras,  acides biliaires, dipeptides, vitamines, carnitines, sucres, steroïdes, lysophospholipides

LC-QToF / GC-MS / GC-QToF

Screening de famille de molécules dans des fluides biologiques dans les domaines de la nutrition santé. 

Matrices biologiques : plasma, serum, urine, tissus, eaux fécales, caecum, contenus digestifs, lait.  

Espèces : humain ou modèles animaux

Fluxomique ciblée    
13C - Acides aminés
GC-MS / GC-c-IRMS

Mesure d'enrichissement isotopique sur plasma et tissus biologiques dans les domaines de la nutrition santé.  

Espèces : humain ou modèles animaux

Identification structuraleLC-LTQ Orbitrap Velos Générer et confirmer des hypothèses de structure pour des identifications de biomarqueurs 
Analyses statistiquesAnalyses uni et multivariées (descriptives, discriminantes, prédictives) sur données métabolomiques, cliniques, nutritionnellesRecherche de biomarqueurs dans des fluides biologiques dans les domaines de la nutrition santé:  biomarqueurs d'exposition nutritionelle, biomarqueurs d'état métabolique, biomarqueurs prédictifs 
BioinformatiqueConstruction de workflows et mise à disposition d'entrepôt de données pour le traitement de données métabolomiquesRecherche de biomarqueurs dans des fluides biologiques dans les domaines de l'environnement

 

UCA

ActivitéTechnologiesdomaine application

Métabolomique non ciblée 

couvrant: acides aminés, acides organiques, acides biliaires, dipeptides, vitamines, carnitines, sucres, steroïdes, lysophospholipides etc…

LC-ESI-QToF/RMNRecherche de biomarqueurs dans des matrices biologiques (extraits microorganismes) dans le domaine de l'environnement
Identification structuraleRMN 1D et 2DGénérer et confirmer des hypothèses de structure pour des identifications de biomarqueurs 
Analyses statistiquesAnalyses uni et multivariées (descriptives, discriminantes, prédictives) sur données métabolomiquesRecherche de biomarqueurs dans les domaines de l'environnement

 

Composante Protéomique

ActivitéTechnologiesdomaine application

Quantification Label Free 

HFX- QExactive

Recherche de  protéines biomarqueurs dans des matrices biologiques 

Matrices biologiques :   biopsies, organes entiers, cultures/extraits cellulaires, contenus digestifs, salive, sang, liquides environnementaux 

Espèces : Multi-espèces (mammifères, oiseaux, insectes, microorganismes, plantes, etc..) 

Quantification ciblée 
(sous réserve de faisabilité)
HFX- QExactive ou QTRAP

Quantification de  protéines et/ou de peptides biomarqueurs dans des matrices biologiques 

Matrices biologiques :  biopsies, organes entiers, cultures/extraits cellulaires, salive, sang,

Espèces : Multi-espèces (mammifères, oiseaux, microorganismes, plantes) 

IdentificationLTQ velos Orbitrap ou HFX- QExactive

Identification de protéines et/ou de peptides dans des matrices biologiques 

Matrices:  salive, biopsies tissulaires, organes entiers, cultures/extraits cellulaires

 Espèces : Multi-espèces (mammifères, oiseaux, insectes, microorganismes, plantes, etc..) 

Imagerie MALDI-TOF 
(sous réserve d'acceptation du projet par une équipe hors PFEM)
AutoFlex-Speed

Recherche de biomarqueurs sur des tissus biologiques (coupes histologiques) 

Matrices biologiques :  biopsies, organes entiers

Espèces : Mammifères, poulet, canard

Profils MALDI-TOFAutoFlex-Speed

Recherche de profils ioniques biomarqueurs sur des tissus ou liquides biologiques

Matrices biologiques :  biopsies, organes entiers, sang, salive, lait, etc...

Espèces : Mammifères, poulet, canard

Quantification d'Acides Aminés 
(Analyses effectuées dans un laboratoire affilié à la PFEM)
Analyseurs d'Acides Aminés

Identification et quantification d'acides aminés dans des matrices biologiques

Matrices biologiques : Alimentaires, contenus digestifs, liquides biologiques divers, etc...  

Espèces : Multi-espèces